PCR實驗是基于核酸水平的微觀樣本實驗,而這些微觀樣本對溫度、ph值等實驗環(huán)境非常敏感,在盡力維護樣本和保存環(huán)境的同時,防止核酸樣本污染也成為不可避免的話題。“易查不易察”,污染來的悄無聲息,今天給大家簡單介紹一下PCR實驗室的主要污染來源、實驗中如何避免和減少污染的可能性及實驗發(fā)生污染的應(yīng)急處理方案。
一、PCR實驗室的污染來源
1、樣本間交叉污染:收集樣本的容器被污染或樣本密封不嚴外溢;不同樣本移液時忘記更換槍尖或未使用帶濾芯槍尖;移液器等實驗器具及耗材未及時消毒滅菌;不同樣本同時開蓋或樣本劇烈震蕩、反復(fù)吹吸導(dǎo)致氣溶膠形成擴散,相互交叉污染。
2、實驗試劑污染:在試劑配制過程中,摻入核酸模板導(dǎo)致污染。
3、擴增產(chǎn)物污染:大量拷貝的產(chǎn)物泄漏或擴增后的PCR反應(yīng)管意外開蓋。
4、克隆質(zhì)粒污染:作為陽性質(zhì)控品的克隆質(zhì)粒外溢。
二、PCR實驗室的防污染方法
1、合理的實驗室分區(qū):試劑準備區(qū)、樣本制備區(qū)和擴增區(qū)內(nèi)的實驗用品,包括移液器等器具應(yīng)專用,空氣、物品流向依次為:試劑準備區(qū)、樣本制備區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū),不可逆行。
2、清潔的實驗用品:實驗室自配試劑(去離子水、緩沖液等)和所有使用器具在使用之前均應(yīng)高壓滅菌或紫外殺菌。槍尖、反應(yīng)管等實驗耗材應(yīng)一次性使用。
三、正確的實驗操作
1、實驗應(yīng)在超凈工作臺內(nèi)進行,工作臺內(nèi)應(yīng)放置PCR專用的微量離心機、各量程的移液器和其他必須物品。
2、實驗的過程中選擇最合適尺寸的手套并能及時更換,在進出不同實驗區(qū)域或進行模板操作后都應(yīng)更換實驗服、口罩、帽子及手套,以避免不同實驗區(qū)交叉污染。
3、裝有PCR試劑的反應(yīng)管在打開之前應(yīng)先瞬時離心,將管壁及管蓋上的液體離至管底,降低污染手套或加樣器的風險。謹慎開啟反應(yīng)管,防止管內(nèi)液體濺出或形成氣溶膠導(dǎo)致污染。
4、吸加試劑和模板的操作應(yīng)嚴格按照規(guī)范要求進行,遵守“慢吸快打”原則,盡量一次性完成,忌多次抽吸,以避免氣溶膠產(chǎn)生的交叉污染。
5、PCR試劑建議小量分裝,以減少反復(fù)凍融、重復(fù)取樣次數(shù)。多樣本PCR反應(yīng)時,先配制反應(yīng)混合液分裝至反應(yīng)管中,最后加入樣本核酸,請勿同時開蓋,盡量保證單人單管,實現(xiàn)完全閉管操作。
6、實驗試劑應(yīng)與樣品和PCR產(chǎn)物分開保存,不應(yīng)放于同處。
7、PCR擴增實驗完成后及時將反應(yīng)管取出,用一次性手套將產(chǎn)物反應(yīng)管包裹丟棄,保證管蓋緊閉。
四、規(guī)范的實驗設(shè)計:應(yīng)遵循實驗室內(nèi)部質(zhì)量控制的相關(guān)規(guī)定,實驗中設(shè)立陽性對照、陰性對照和空白對照,全程質(zhì)控實驗過程,驗證PCR反應(yīng)的可靠性,并協(xié)助判斷擴增系統(tǒng)的可信性。
五、PCR實驗室的污染應(yīng)急處理方法
1、若核酸樣本溢出:應(yīng)立即用布或紙巾覆蓋,由外圍向中心傾倒10%的次氯酸消毒劑,約30分鐘后,清除污染物品,再用次氯酸消毒劑擦拭,并用75%酒精噴灑,移動紫外車定點照射1小時。

2、其他不明情況污染:應(yīng)暫停所有實驗操作,清理實驗室內(nèi)所有物品,尋找污染來源。同時加大實驗室的通風,對實驗室內(nèi)所有表面(臺面、地面及墻面) 進行消毒,用75%酒精空中噴霧。開啟紫外消毒裝置,延長紫外照射時間(4小時以上)。以上措施每日進行,直至污染消除;用新試劑及確認無污染的器材進行原污染項目的試劑空白檢測,連續(xù)3次均陰性后方可進行常規(guī)檢測。
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